自20世紀90年代初,美國Affymetrix公司的Fodor博士提出并開始基因芯片技術(shù)以來,基因芯片技術(shù)已在醫(yī)學(xué)的各領(lǐng)域顯示出廣闊的應(yīng)用前景。由于其具有高通量、快速、樣品用量少、高信息量等優(yōu)點,世界上許多國家和地區(qū)紛紛著手進行基因芯片的研制和開發(fā)工作。我國政府對人類基因的研究也非常重視。2000年7月3日,我國首家DNA公共數(shù)據(jù)建成并投入試運行。我國也首次獲得了一批人類全長新基因等重要研究成果。,我國政府正在積極規(guī)劃今后五年人類基因組的研究方向。
中醫(yī)藥學(xué)在世界醫(yī)學(xué)發(fā)展史上曾處于領(lǐng)先地位,數(shù)千年來對我國和世界人民的健康做出了巨大的貢獻。但是受傳統(tǒng)觀念和技術(shù)的影響,中醫(yī)藥學(xué)的發(fā)展十分緩慢,目前主要面臨兩大挑戰(zhàn):一是中醫(yī)藥自身的突破和發(fā)展,二是中醫(yī)藥如何能被世界人民所接受。而兩個問題的焦點就是中醫(yī)藥的現(xiàn)代化。正如楊煥明教授所說,基因組學(xué)是中醫(yī)藥現(xiàn)代化的最佳切入點??梢灶A(yù)見,把基因芯片這種系統(tǒng)、全面、綜合的研究思維方式應(yīng)用于中醫(yī)藥學(xué),必將為中醫(yī)藥研究帶來又一次跳躍性的發(fā)展。下面就基因芯片技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域的可能應(yīng)用作一簡要的概括和分析。
一、在中醫(yī)證的研究中的應(yīng)用
對“證”的認識是中醫(yī)學(xué)的核心問題。證的形成機理十分復(fù)雜,它包含著全身不同系統(tǒng)、不同組織及細胞、分子水平的綜合變化。證的研究之所以沒有突破性進展,筆者認為關(guān)鍵就在于沒有明確的量化指標,從而無法從指標的變化中認識其本質(zhì)。在證的理論形成中,還包含有以方測證的重要內(nèi)容。我們可以利用這一思路,當對某一證的動物模型,或在疾病的模型基礎(chǔ)上通過辨證,區(qū)不同的證的動物模型的主要組織病變了解后,便可以用基因芯片技術(shù)觀察有關(guān)組織基因的變異,以了解證與證、證與病、證與體質(zhì)之間的差異。當辨證論治取效后,再采用基因芯片技術(shù)觀察治療前后有關(guān)組織基因轉(zhuǎn)錄的差異,來解釋證和辨論治在基因水平上的機制與因果關(guān)系,以發(fā)展證及證治的中醫(yī)基礎(chǔ)理論。
二、在經(jīng)絡(luò)現(xiàn)象研究中的應(yīng)用
針灸治療方法簡潔、方便、有效,在國際上具有廣泛的影響。古代對經(jīng)絡(luò)現(xiàn)象的認識并不是建立在嚴格的科學(xué)實驗基礎(chǔ)上的,但經(jīng)絡(luò)理論能夠有效指導(dǎo)臨床,就應(yīng)該有其物質(zhì)基礎(chǔ)。我們可以根據(jù)針灸經(jīng)絡(luò)理論,采用基因芯片技術(shù)觀察不同穴位、不同刺激方法、頻率和強度導(dǎo)致有關(guān)組織基因轉(zhuǎn)錄的差異等,觀察針灸治療不同疾病和相應(yīng)證的具體途徑,從而揭示經(jīng)絡(luò)現(xiàn)象的深層本質(zhì)。
三、在中藥品種鑒定研究中的應(yīng)用
我國中藥資源十分豐富,商品藥材的種類繁多,經(jīng)典的來源、性狀、理化性質(zhì)鑒定方法,并不能滿足中藥真?zhèn)蝺?yōu)劣鑒別的需要,尤其是不能滿足對如動物藥材、道地藥材、加工炮制的藥材以及中藥復(fù)方制劑組分鑒定等的需要。利用基因芯片技術(shù)可以通過對待檢樣品與標準樣品雜交后進行熒光檢測及結(jié)果分析,實現(xiàn)快速、準確的中藥基因鑒定,從而實現(xiàn)中藥材的標準化、規(guī)范化、優(yōu)質(zhì)化。
四、在中藥資源的豐富和優(yōu)化研究方面的應(yīng)用
中藥材來源于自然界,其品種的多樣性由生物多樣性決定。近年來隨著生態(tài)環(huán)境的惡化和人為的過度墾伐,一些生物物種已瀕臨滅絕,因而嚴格限制其應(yīng)用于臨床。如犀角、虎骨、穿山甲、雪蓮等等。利用基因技術(shù)可以對這些瀕危物種進行研究,找出其特征性的基因,并通過基因工程技術(shù),實現(xiàn)生物物種的大規(guī)模繁殖。對于不能克隆的物種,可以通過DNA序列的相關(guān)性,尋找其親緣關(guān)系相近的物種,發(fā)現(xiàn)其藥用的替代品,實現(xiàn)中藥資源的豐富和優(yōu)化。
五、在中藥藥理學(xué)和毒理學(xué)研究中的應(yīng)用
藥物作于人體,都有其作用部位的“靶點”。凡對病有效的方藥,必有其“靶基因”。利用基因芯片技術(shù)比較用藥前后基因表達譜的改變、不同時間和用量基因表達譜的差異等分子機制,可以從深層次認識中藥的作用機理,并對其做出正確合理的評價。這將有利于指導(dǎo)臨床用藥和豐富發(fā)展中醫(yī)藥理論。
六、在中藥新藥研究中的應(yīng)用
新藥的研制一般是根據(jù)疾病的發(fā)病機制確定藥物的作用靶點,建立相應(yīng)的藥物篩選模型,發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物,將其開發(fā)成新藥。而所有的藥物都是直接或間接地通過修飾、改變和影響人類或病原微生物的基因表達或表達產(chǎn)物的功能而產(chǎn)生療效?;蛐酒捌湎嚓P(guān)技術(shù)可用于大規(guī)模的藥物篩選,減少大量的動物實驗和臨床工作,加快新藥研制的步伐。另外,把基因技術(shù)應(yīng)用于新藥的研究,還可以提高我國新藥研究的水平,加速中藥進入國際大市場的步伐。海洋是人類生命的起源,海洋生物作為新興的藥物來源,已成為世界各國新藥研制的熱點。我國自古就有以海洋生物入藥的習(xí)慣,利用基因芯片技術(shù)分析發(fā)現(xiàn)這些藥物的活性基因組分,并利用基因工程技術(shù)進行大規(guī)模生產(chǎn),將極大地提高我國海洋藥物的研制水平。
DNA芯片又稱基因芯片,DNA是人類的生命遺傳物質(zhì)脫氧核糖核酸的簡稱。因為DNA分子鏈是以ATGC(A-T、G-C)為配對原則的,它采用一種叫做“在位組合合成化學(xué)”和微電子芯片的光刻技術(shù)或者用其他方法,將大量特定順序的·DNA片段,有序地固化在玻璃或者硅片上,從而構(gòu)成儲存有大量生命信息的DNA芯片。
基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。
當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應(yīng)位置的核酸探針產(chǎn)生互補匹配時,通過確定熒光強度最強的探針位置,獲得一組序列完全互補的探針序列。據(jù)此可重組出靶核酸的序列。
優(yōu)點
1、在實際應(yīng)用方面,生物芯片技術(shù)可廣泛應(yīng)用于疾病診斷和治療、藥物篩選、農(nóng)作物的優(yōu)育優(yōu)選、司法鑒定、食品衛(wèi)生監(jiān)督、環(huán)境檢測、國防、航天等許多領(lǐng)域。
2、它將為人類認識生命的起源、遺傳、發(fā)育與進化、為人類疾病的診斷、治療和防治開辟全新的途徑,為生物大分子的全新設(shè)計和藥物開發(fā)中先導(dǎo)化合物的快速篩選和藥物基因組學(xué)研究提供技術(shù)支撐平臺。
缺點:
1、技術(shù)成本昂貴、復(fù)雜;
2、檢測靈敏度較低;
3、重復(fù)性差;
4、分析泛圍較狹窄。
基因測序,一種新型基因檢測技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預(yù)測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理?;驕y序技術(shù)能鎖定個人病變基因,提前預(yù)防和治療。
優(yōu)點
1、一種很好的治療手段;
2、基因測序技術(shù)能鎖定個人病變基因,提前預(yù)防和治療。
缺點
1、若全基因的檢測普及,含有基因缺陷的人的信息,一旦落入被測者雇主的手中,將對他的生活產(chǎn)生不良影響。
2、而且基因測序而不確定是個性化治療的唯一基礎(chǔ),其他還包括基因治療等其他技術(shù)基礎(chǔ)。更重要的是,對于任何基因測序的設(shè)備來說,用于臨床前必須對其可靠性和可重復(fù)性做好完備的臨床試驗,并且取得FDA和CFDA的權(quán)威認證。
擴展資料
基因芯片,由于所使用的標記物不同,因而相應(yīng)的探測方法也各具特色。大多數(shù)研究者使用熒光標記物,也有一些研究者使用生物素標記,聯(lián)合抗生物素結(jié)合物檢測DNA化學(xué)發(fā)光。通過檢測標記信號來確定DNA芯片雜交譜型。
基因測序,本是一種實驗室研究技術(shù)手段,因“名人效應(yīng)”應(yīng)用于高端體檢、產(chǎn)前診斷等領(lǐng)域,價格不菲?;驕y序最廣為人知的,是影星安吉麗娜·朱莉通過基因檢測,選擇手術(shù)切除乳腺以降低患乳腺癌風險。2011年去世的蘋果公司創(chuàng)始人史蒂夫·喬布斯患癌時,也曾接受過全基因測序。
-基因測序
-基因芯片
基因芯片(又稱 DNA 芯片、生物芯片)技術(shù)就是順應(yīng)這一科學(xué)發(fā)展要求的產(chǎn)物,它的出現(xiàn)為解決此類問題提供了光輝的前景。該技術(shù)系指將大量(通常每平方厘米點陣密度高于 400 )探針分子固定于支持物上后與標記的樣品分子進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。通俗地說,就是通過微加工技術(shù) ,將數(shù)以萬計、乃至百萬計的特定序列的DNA片段(基因探針),有規(guī)律地排列固定于2cm2 的硅片、玻片 等支持物上,構(gòu)成的一個二維DNA探針陣列,與計算機的電子芯片十分相似,所以被稱為基因芯片?;蛐酒饕糜诨驒z測工作 。 早在八十年代, Bains W. 等人就將短的 DNA 片斷固定到支持物上,借助雜交方式進行序列測定。但基因芯片從實驗室走向工業(yè)化卻是直接得益于探針固相原位合成技術(shù)和照相平板印刷技術(shù)的有機結(jié)基因芯片
合以及激光共聚焦顯微技術(shù)的引入。它使得合成、固定高密度的數(shù)以萬計的探針分子切實可行,而且借助基因芯片
激光共聚焦顯微掃描技術(shù)使得可以對雜交信號進行實時、靈敏、準確的檢測和分析。正如電子管電路向晶體管電路和集成電路發(fā)展是所經(jīng)歷的那樣,核酸雜交技術(shù)的集成化也已經(jīng)和正在使分子生物學(xué)技術(shù)發(fā)生著一場革命。現(xiàn)在全世界已有十多家公司專門從事基因芯片的研究和開發(fā)工作,且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問世。主要代表為美國 Affymetrix 公司。該公司聚集有多位計算機、數(shù)學(xué)和分子生物學(xué)專家,其每年的研究經(jīng)費在一千萬美元以上,且已歷時六七年之久,擁有多項專利。產(chǎn)品即將或已有部分投放市場,產(chǎn)生的社會效益和經(jīng)濟效益令人瞻目。 基因芯片技術(shù)由于同時將大量探針固定于支持物上,所以可以一次性對樣品大量序列進行檢測和分析,從而解決了傳統(tǒng)核酸印跡雜交(Southern Blotting 和 Northern Blotting 等)技術(shù)操作繁雜、自動化程度低、操作序列數(shù)量少、檢測效率低等不足。而且,通過設(shè)計不同的探針陣列、使用特定的分析方法可使該技術(shù)具有多種不同的應(yīng)用價值,如基因表達譜測定、實變檢測、多態(tài)性分析、基因組文庫作圖及雜交測序等。
弊端:第一:生物芯片技術(shù)還只是在研發(fā)階段,并沒有轉(zhuǎn)化為商品進行大量的使用,是因為該技術(shù)仍存在許多問題。最主要的問題是成本過高,目前的生物芯片技術(shù)需一系列昂貴的尖端儀器,如光刻機器、寡核苷酸合成儀和激光共聚焦顯微器等設(shè)備,如 Affymetrix 的一套系統(tǒng)需要 13.5 萬美元,對普通的實驗室來說開支較大,是生物芯片技術(shù)推廣的一大障礙。而且樣品制備和待測定靶標探針標記方法復(fù)雜,需專項技術(shù)人員才可以操作,這都導(dǎo)致研究成本相對較高,無法普及。第二,目前的芯片存在不同程度的假陽性,重復(fù)性也有差異,這可能與靶分子濃度、探針濃度、雜交雙方的序列組成、鹽濃度及溫度等對雜交的動力學(xué)存在影響有關(guān),因此需要充分研究這些物質(zhì)的物化性質(zhì),提高芯片的特異性。第三,是芯片的標準化問題,即如何將不同實驗室、不同操作人員做出的結(jié)果進行統(tǒng)一化、標準化,尤其對那些表達量低、差異不明顯的基因就更為重要,目前認為,這些誤差可以通過傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)分析技術(shù)如酶譜、雙向電泳、免疫組織化學(xué)等方法進行驗證。第四,基因組學(xué)的資源庫還需要極大的豐富,信號檢測的靈敏度需要增加。芯片發(fā)展的最終目標是實現(xiàn)從樣品制備、化學(xué)反應(yīng)到檢測的整個分析過程的集成化,組成微型全分析系統(tǒng),實現(xiàn)自動化。隨著新材料、新技術(shù)的不斷開發(fā),生物芯片的應(yīng)用領(lǐng)域必然會繼續(xù)從實驗室研究應(yīng)用擴展到臨床應(yīng)用等更廣的范圍。
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