中藥復(fù)方研究的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)技術(shù)

中藥復(fù)方研究的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)技術(shù)

中藥復(fù)方是一復(fù)雜的分子體系，在制劑過程中藥物之間的不同組分也隨著復(fù)雜的物理和化學(xué)變化，可能形成各種復(fù)合物，從而導(dǎo)致中藥及復(fù)方具有多靶酶、多靶點(diǎn)、多環(huán)節(jié)作用的特點(diǎn)。隨著信息時(shí)代的到來，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)在藥物設(shè)計(jì)研究中得到廣泛的應(yīng)用，因此不妨將計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)移植于中藥復(fù)方的研究領(lǐng)域，將中藥配伍規(guī)律和作用機(jī)制的研究載入一個(gè)虛擬的世界，可能為探討中藥防治疾病的現(xiàn)代科學(xué)依據(jù)拓展一個(gè)嶄新的空間。

為藥物設(shè)計(jì)開辟虛擬空間

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)依據(jù)對分子理化性質(zhì)如分子極性、所帶電荷、水溶性和分配系數(shù)等參數(shù)的計(jì)算分析，可以在計(jì)算機(jī)上方便快捷地建造、分析和修改分子結(jié)構(gòu)并利用三維技術(shù)實(shí)時(shí)顯示其立體結(jié)構(gòu)，計(jì)算分子能量和立體化學(xué)性質(zhì)及物理化學(xué)性質(zhì)，推算出各種低能構(gòu)象，進(jìn)行構(gòu)象分析并與酶模型相結(jié)合，對藥物分子進(jìn)行定量設(shè)計(jì)，并利用系統(tǒng)軟件對候選物結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化，由此推斷其活性構(gòu)象，設(shè)計(jì)新的藥物分子。計(jì)算機(jī)系統(tǒng)根據(jù)軟藥原理對先導(dǎo)化合物進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造，獲得候選化合物，通過系統(tǒng)軟件對分子的理化參數(shù)進(jìn)行分析，確立篩選依據(jù)，獲得安全有效的藥物分子。

有望闡明中藥復(fù)方作用機(jī)制

中藥復(fù)方是由多味中藥配伍在一起，共同起到各單味藥所不能起到的作用。中藥復(fù)方配伍的化學(xué)成分不是各單味藥化學(xué)成分的簡單相加，其療效也不是各單味藥的簡單疊加，復(fù)方通過藥物成分間發(fā)生協(xié)同、制約或改性等作用來達(dá)到減毒增效的目的。闡明復(fù)方配伍的化學(xué)物質(zhì)成分以及多靶點(diǎn)效應(yīng)機(jī)制，是突破中藥研發(fā)現(xiàn)狀的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一，也是解決中藥與國際醫(yī)藥發(fā)展趨勢接軌問題的必經(jīng)之路。隨著x射線衍射以及核磁共振等技術(shù)的發(fā)展，越來越多的生物大分子的三維結(jié)構(gòu)被測定出來，使基于受體結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)具現(xiàn)實(shí)意義，分子對接方法可謂其中的重中之重。分子對接法是基于受體大分子三維結(jié)構(gòu)來尋找先導(dǎo)化合物的重要方法，就是兩個(gè)或多個(gè)分子之間通過幾何匹配和能量匹配而相互識別的過程，也是計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)中最為重要的方法之一，為中藥研究提供了新思路和新方法。

在機(jī)體內(nèi)藥物分子與受體充分接近，在必要的部位相互契合、相互作用后，可通過適當(dāng)?shù)臉?gòu)象調(diào)整，得到一個(gè)穩(wěn)定的復(fù)合物構(gòu)象，這是藥物分子產(chǎn)生藥效反應(yīng)的重要過程。生物大分子和藥物小分子的各種表面性質(zhì)，可用分子對接法來計(jì)算。對接計(jì)算時(shí)，將配體分子放到受體活性位點(diǎn)，然后按照幾何互補(bǔ)、能量互補(bǔ)以及化學(xué)環(huán)境互補(bǔ)的原則來實(shí)時(shí)評價(jià)配體與受體相互作用的好壞，并找到兩個(gè)分子之間最佳的結(jié)合模式。通過分子對接法確定復(fù)合物中兩個(gè)分子正確的相對位置和取向，研究兩個(gè)分子的構(gòu)象特別是底物構(gòu)象在形成復(fù)合物過程中的變化，是確定藥物作用機(jī)制、設(shè)計(jì)新藥的基礎(chǔ)。由于中藥復(fù)方的有效成分多為小分子物質(zhì)，因此借助計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的分子對接法可闡明中藥復(fù)方作用機(jī)制，這可能是連接傳統(tǒng)中藥學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)的紐帶。

在中藥新藥研發(fā)中的意義

用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的分子對接法研究中藥化學(xué)成分與靶酶的相互作用，分析中藥多靶點(diǎn)機(jī)制更直觀、明確，可使復(fù)方從單味藥組方進(jìn)入活性物質(zhì)配伍研究的新層面。雖然這只是計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)，但卻具有很強(qiáng)的理論性和科學(xué)性。利用計(jì)算機(jī)模擬方法探討中藥的作用機(jī)制，不僅可以彌補(bǔ)動物藥理實(shí)驗(yàn)方法的缺陷，也減少了人力和物力的投入，更重要的是在中藥新藥研究領(lǐng)域，建立了全新的理念和先進(jìn)的研究手段，有望使中藥現(xiàn)代化真正跨入一個(gè)寬廣的良性發(fā)展的軌道。

中藥組分為何成為中藥新藥開發(fā)輔助設(shè)計(jì)的“及時(shí)雨”?

有提高新藥開發(fā)效率、創(chuàng)新新藥研發(fā)、降低新藥開發(fā)成本的原因。
1、中藥復(fù)方中的藥物成分已經(jīng)經(jīng)過長期的臨床應(yīng)用和研究，具有一定的藥效和安全性，可以為新藥的開發(fā)提供先驗(yàn)知識，縮短開發(fā)周期和降低開發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。
2、中藥復(fù)方中的藥物成分具有多種作用，可以用于發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)，開發(fā)新的藥物，提高新藥的療效和安全性。
3、中藥復(fù)方中的藥物成分已經(jīng)經(jīng)過長期的臨床應(yīng)用和研究，可以節(jié)省新藥開發(fā)的時(shí)間和費(fèi)用，降低開發(fā)成本。

你好，，向您請教一下，東北林業(yè)大學(xué)森林植物生態(tài)學(xué)重點(diǎn)研究實(shí)驗(yàn)室，植物學(xué)方向碩士研究生導(dǎo)師

嘿，哥們，你找到合適的人！我的導(dǎo)師經(jīng)常項(xiàng)目合作的王！植物生態(tài)學(xué)
森林植物生態(tài)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，教育部（東北林業(yè)大學(xué)）
生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)科簡介
學(xué)校紀(jì)律的生物化學(xué)與分子生物學(xué)在森林中的關(guān)鍵點(diǎn)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，教育部宣布，該組織正式成立于2002年12月，在黑龍江省重點(diǎn)學(xué)科敞開了大門，并于2003年，碩士和博士學(xué)位。分子生態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)的研究方向是顯而易見的，已經(jīng)形成了一種植物分子生態(tài)學(xué)，植物基因工程和蛋白質(zhì)工程，植物的新陳代謝，分子生物學(xué)，植物細(xì)胞和分子生物學(xué)和植物對逆境的顯著特征，分子生物學(xué)，主要反映的是相對穩(wěn)定的，的五項(xiàng)研究的基礎(chǔ)研究和應(yīng)用基礎(chǔ)研究，國家生態(tài)環(huán)境建設(shè)和草，食品，和美國國土安全部的利益，是一個(gè)迫切需要韌性基因的分離，培養(yǎng)新品種深厚的理論根據(jù)學(xué)科特點(diǎn)表明，植物逆境生態(tài)適應(yīng)與生態(tài)進(jìn)化機(jī)制，促進(jìn)東北林業(yè)在生態(tài)建設(shè)和經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)調(diào)整的困難具有非常重要的意義。
日趨合理的學(xué)術(shù)梯隊(duì)。現(xiàn)有學(xué)科的教學(xué)和科研人員10人，其中教授3人（博士生導(dǎo)師），副教授，具有博士學(xué)位的教師達(dá)68％。有10名研究生，碩士研究生，博士畢業(yè)生。
研究平臺，完成設(shè)置。對象取決于重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，森林植物生態(tài)學(xué)教育部教育，環(huán)境研究中心的學(xué)術(shù)帶頭人鹽堿地生物資源，現(xiàn)場實(shí)驗(yàn)基地，總投資20萬元的大型進(jìn)口精密儀器和設(shè)備，二維電泳和蛋白，蛋白純化工作站平臺的研究基于核酸的平臺，普通和定量PCR，DNA測序儀，DNA合成儀，凝膠成像儀，激光掃描共聚焦顯微鏡，熒光顯微鏡，顯微鏡系統(tǒng)，原子力顯微鏡為基礎(chǔ)的細(xì)胞生物學(xué)研究平臺，便攜式光合作用系統(tǒng)，LC-MS/MS，液相色譜，毛細(xì)管電泳法，發(fā)酵代謝生物學(xué)研究平臺的設(shè)備。
的作用日益顯著。這個(gè)主題已經(jīng)被發(fā)表在科學(xué)出版學(xué)術(shù)專著，發(fā)表學(xué)術(shù)論文60余篇，主持了11項(xiàng)國家和省部級科研資金600萬美元。
電話：82190259
關(guān)于金博士
藥房藥學(xué)學(xué)科國家重點(diǎn)學(xué)科 - 東北林業(yè)大學(xué)植物學(xué)基礎(chǔ)，依托森林植物生態(tài)學(xué)，教育部，國務(wù)院學(xué)位辦公室教育在2003年批準(zhǔn)成立的第一個(gè)主要的學(xué)科 - 制藥實(shí)驗(yàn)室，制藥學(xué)科的空白，以填補(bǔ)我的學(xué)校，學(xué)校向?qū)W生敞開了大門，2004年，為學(xué)校的建設(shè)成為一個(gè)多學(xué)科，多類綜合性大學(xué)，起到了積極的作用。經(jīng)過多年的建設(shè)和發(fā)展本學(xué)科的藥材，包括GAP種植的植物中的有效成分，有效分離，結(jié)構(gòu)修飾的植物活性成分，植物活性成分，高通量篩選的植物資源，有效利用研究小組提出了一系列創(chuàng)新性成果，并獲得了中國傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，黑龍江?。?004年批準(zhǔn)），林業(yè)，生物制劑，工程教育研究中心，教育部，教育部批準(zhǔn)（2006年），并于2006年榮獲黑龍江省重點(diǎn)學(xué)科，以及小型和中型的企業(yè)在黑龍江省的普通技術(shù)人員，以促進(jìn)研究和開發(fā)中心，2007年，第二批。藥劑合理的學(xué)科的學(xué)術(shù)梯隊(duì)，匯集到一起的組合，其中大部分是中年和青年教師，博士生導(dǎo)師，教授，副教授，講師，助教。 45個(gè)文件，其中包括14篇SCI論文，EI收錄6，已培訓(xùn)了15名研究生和研究生供不應(yīng)求，就業(yè)率達(dá)到100％。
學(xué)科三個(gè)主要的研究方向。該方向的研究藥用植物資源，中國傳統(tǒng)中藥資源保護(hù)和再生的中國中藥材及中藥材質(zhì)量評價(jià)研究的真實(shí)性。第二個(gè)研究方向：中國傳統(tǒng)醫(yī)藥的研究和開發(fā)，主要用于基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究，中國傳統(tǒng)醫(yī)藥和活性成分，在中國，中國中藥標(biāo)準(zhǔn)化及質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的研究質(zhì)量評估。研究方向：天然活性成分和結(jié)構(gòu)的變化，包括它們的活性，將所得的化合物具有一個(gè)新的結(jié)構(gòu)，或具有生物活性的單體的提取，提取和分離的條件下，結(jié)構(gòu)鑒定，對象的一般活動和目的，創(chuàng)新藥物，天然活性化合物，鉛化合物，合成一系列結(jié)構(gòu)類似物的結(jié)構(gòu) - 活性關(guān)系的研究的效率和低的毒性。結(jié)合
有效地利用藥用植物資源學(xué)科的基礎(chǔ)研究，應(yīng)用研究，技術(shù)開發(fā)和產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新的學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略，建立學(xué)科基地和人才培訓(xùn)中心的競爭力的影響
聯(lián)系：傅教授宇杰82190535
藥物MA
藥物MA是在學(xué)校的主要議題之一，依靠森林植物生態(tài)學(xué)，生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的個(gè)人實(shí)驗(yàn)室，教育和林業(yè)重點(diǎn)學(xué)科，教育部金融教育廳工程技術(shù)研究中心，從2007年招收研究生的學(xué)科，教授，副教授，17個(gè)博士后經(jīng)驗(yàn)，博士20（3）國外學(xué)歷，7個(gè)博士后研究人員在美國，現(xiàn)有博士生導(dǎo)師在美國，德國，英國和其他的美德，政府補(bǔ)貼和凝聚力的大多數(shù)國家，以獲得合理的學(xué)術(shù)梯隊(duì)，學(xué)術(shù)，具有博士學(xué)位和經(jīng)驗(yàn)，進(jìn)一步研究和實(shí)質(zhì)性的學(xué)術(shù)交流和合作關(guān)系的日本外交的骨干。在過去的五年中，國際期刊和會議論文200余篇，申報(bào)專利10余項(xiàng)，出版專著7個(gè)國家科學(xué)技術(shù)發(fā)明獎二等獎，國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎，省，市科學(xué)和技術(shù)科學(xué)出版科技進(jìn)步獎和技術(shù)發(fā)明獎的學(xué)科，承擔(dān)國際合作項(xiàng)目和項(xiàng)目在這三個(gè)國家的德國，和中國國家自然科學(xué)基金，省部級項(xiàng)目6，七橫的問題，已經(jīng)積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)，研究和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，及時(shí)教學(xué)，教學(xué)和科研有機(jī)地結(jié)合起來，相互促進(jìn)，培養(yǎng)了一批高素質(zhì)的人才隊(duì)伍，發(fā)揮了一定的作用，通過教學(xué)和科研工作。
發(fā)展的跨學(xué)科研究的特點(diǎn)和應(yīng)用前景的天然產(chǎn)物藥物在中國傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)在中國幾千年多年的歷史，有著深厚的中醫(yī)臨床基礎(chǔ)正在尋找創(chuàng)新藥物體力活動前的跟蹤和鉛化合物，鉛化合物材料基礎(chǔ)上的自然活躍的物質(zhì)，在人體的新陳代謝，為了以澄清該藥物的來源在中國，組合化學(xué)，計(jì)算機(jī)，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)和目標(biāo)的互動計(jì)算平臺的評價(jià)，新設(shè)計(jì)的小分子導(dǎo)致復(fù)合，利用現(xiàn)代科學(xué)和技術(shù)及發(fā)現(xiàn)的藥品和創(chuàng)新藥品到中國的自己的知識產(chǎn)權(quán)財(cái)產(chǎn)權(quán)利和財(cái)產(chǎn)權(quán)利的發(fā)展結(jié)構(gòu)修飾，利用現(xiàn)代生物技術(shù)方法進(jìn)行了天然藥物和機(jī)制行動，他們的目標(biāo)開發(fā)新的藥物，并奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)。實(shí)驗(yàn)組合化學(xué)，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)和分子生物學(xué)平臺的目標(biāo)，一直從事的工作經(jīng)驗(yàn)的人員從事研究生產(chǎn)力體驗(yàn)長期的合作研究，研究，林業(yè)和生物制品工程技術(shù)研究中心，教育部社會服務(wù)，與國內(nèi)著名科研機(jī)構(gòu)。
聯(lián)系人：李醫(yī)生輕擁82192336

基于配體結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)有哪些研究內(nèi)容和方法

基于配體結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)可以按照要求。

基于配體的藥物分子設(shè)計(jì)，既可以用于藥物虛擬篩選，也可以用于反向?qū)ぐ?，譬如藥物篩選管理系統(tǒng)（DSMS），基于二維或三維相似度等手段，進(jìn)行虛擬篩選；又譬如藥物靶點(diǎn)預(yù)測系統(tǒng)（DTPS），基于相似度進(jìn)行靶點(diǎn)預(yù)測。

擴(kuò)展資料：

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的一般原理是，首先通過X－單晶衍射技等技術(shù)獲得受體大分子結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)，并且采用分子模擬軟件分析結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)性質(zhì)，如靜電場、疏水場、氫鍵作用位點(diǎn)分布等信息。

然后再運(yùn)用數(shù)據(jù)庫搜尋或者全新藥物分子設(shè)計(jì)技術(shù)，識別得到分子形狀和理化性質(zhì)與受體作用位點(diǎn)相匹配的分子，合成并測試這些 分子的生物活性，經(jīng)過幾輪循環(huán)，即可以發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物。因此，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)大致包括活性位點(diǎn)分析法、數(shù)據(jù)庫搜尋、全新藥物設(shè)計(jì)。

-計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)

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