新“分子時(shí)鐘”預(yù)測(cè)癌癥更近一步

日前，中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)研究所與英國(guó)倫敦大學(xué)學(xué)院的研究人員在《基因組生物學(xué)》雜志上合作發(fā)表的一項(xiàng)最新研究成果表明，生命周期中細(xì)胞分裂導(dǎo)致的dna分子變異積累可被用于癌癥發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)。

組織細(xì)胞的分裂速度與該組織的癌癥發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)高度相關(guān)。研究人員利用計(jì)算建模方法設(shè)計(jì)了一個(gè)“分子時(shí)鐘”，并利用它對(duì)個(gè)體特定組織生命周期中細(xì)胞分裂的次數(shù)進(jìn)行估算。他們同時(shí)針對(duì)一種只在dna特定序列上發(fā)生的修飾，即dna甲基化修飾，設(shè)計(jì)出變異的“有絲分裂時(shí)鐘”運(yùn)行節(jié)律。

研究表明，基因組特定位點(diǎn)的dna甲基化會(huì)隨著個(gè)體生理年齡的增加而積累，這一發(fā)現(xiàn)表明可利用這一“分子時(shí)鐘”對(duì)個(gè)體年齡進(jìn)行精確預(yù)測(cè)。然而，同一個(gè)體中不同器官組織雖然具有相同的生理年齡，但卻具有不同的癌癥發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)，因此該基于dna甲基化的早期“時(shí)鐘”無(wú)法用于癌癥發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)。

由計(jì)算生物學(xué)所研究員、英國(guó)倫敦大學(xué)學(xué)院教授andrew teschendorff領(lǐng)導(dǎo)的研究組，構(gòu)建了一種新“分子時(shí)鐘”用于預(yù)測(cè)組織干細(xì)胞的分裂次數(shù)。

研究發(fā)現(xiàn)，癌癥細(xì)胞的有絲分裂節(jié)律明顯加速，該現(xiàn)象同樣發(fā)生于包括乳腺及肺等多種組織癌前病變過(guò)程中，提示基于這種新的“分子時(shí)鐘”研究可用于癌癥發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)。

專家認(rèn)為，這一發(fā)現(xiàn)揭示了對(duì)相應(yīng)細(xì)胞類型dna甲基化水平進(jìn)行檢查可用于癌癥的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)及相關(guān)早期檢測(cè)方法的開(kāi)發(fā)。

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